有这些区别：
1.公积金贷款利息比自营性贷款低。
2.自营性贷款不受个人所交公积金数额影响，只受房价的80%这一上限控制；公积金贷款的上限既要受房价80%这一比例控制，又要依照个人所交公积金数额计算贷款上限。（才有组合贷款一说）。3．承担风险的主体不同。公积金个人住房贷款是一种委托性住房贷款，它是国家住房公积金管理部门用归集的住房公积金资金，由政府设立的住房置业担保机构提供担保，委托商业银行发放给公积金缴存人的住房贷款。从风险承担的角度讲，商业银行本身不承担贷款风险。而自营性个人住房贷款是商业银行使用自有信贷资金发放的住房贷款，商业银行自己承担贷款风险。4．资金来源不同。公积金个人住房贷款的资金来自公积金管理部门归集的住房公积金，而商业银行的自营性个人住房贷款整合自银行自有的信贷资金。5．贷款对象不同。公积金个人住房贷款的对象需要是住房公积金缴存人，而商业银行自营性个人住房贷款不需要是住房公积金缴存人，而是符合商业银行自营性个人住房贷款条件的、具有完全民事行为能力的自然人。6．贷款利率不同。公积金个人住房贷款的利率比自营性个人住房贷款利率低。7．审批主体不同。公积金个人住房贷款与商业银行自营性个人住房贷款审批之间存在区别。公积金个人住房贷款的申请由各地方公积金管理中心负责审批，而自营性个人住房贷款由商业银行自己审批。

1）住房公积金贷款利率比商业银行住房贷款利率低。五年（含五年）以下公积金贷款年利率为3.6%，商业银行同期个人住房贷款利率为4.77%；五年以上住房公积金住房贷款年利率为4.05%，商业银行同期个人住房贷款利率为5.04%。2）贷款对象的条件要求不同。公积金贷款对象需要是北京公积金系统公积金缴存人；商业住房贷款不需要是公积金缴存人。3）对贷款人年龄的限制不同。通常来讲商业银行个人住房贷款有年龄上限；而公积金住房贷款没有年龄的限制。4）商业银行住房贷款最高可以贷到房屋总价的80%，依照所购住房性质不同，住房公积金贷款可以贷到房屋总价的95%或90%。5）贷款的担保方式不同。商业银行贷款通常是在房产证抵押登记前采用开发商阶段性连带责任保证担保方式，在抵押登记后采用抵押的担保方式；公积金贷款担保方式主要是北京市住房贷款担保中心所提供的连带责任担保。6）所需要费用不同。商业银行住房贷款通常需要律师费用、保险费用；北京市住房贷款担保中心办理住房公积金住房贷款通常只需要担保费和评估费。7）对单笔贷款最高额度规定不同，通常来说，商业银行住房贷款对单笔贷款最高额度没有规定；而公积金贷款现在最高只能够贷40万。8）公积金管理中心为住房公积金贷款的借款人统一向中国太平洋财产保险股份有限公司购买了个人抵押商品住房保险。保险融合了财产损失保险和人身意外伤害保险两方面的内容，使借款人免费享受到保险；而通常商业银行住房贷款，借款人无法免费享受这方面的保险。

一、南宁住房公积金个人住房贷款条件。
1、职工连续足额缴存住房公积金6个月(含)以上，可申请住房公积金个人住房贷款。
2、对曾经在异地缴存住房公积金、在我市缴存不满6个月的，缴存时间可依照原缴存地住房公积金管理中心出具的缴存证明合并计算。
二、异地贷款。户籍在我市但在就业地(外地)缴存住房公积金的职工，在我市购买自住住房的，可持就业地住房公积金管理中心出具的缴存证明，向我市住房公积金管理中心申请住房公积金个人住房贷款。
三、同时进行住房公积金和商业银行贷款。住房公积金贷款额度不能满足职工贷款需求的，职工可同时向商业银行申请住房贷款。
四、商业银行个人住房贷款可以转住房公积金个人住房贷款。职工已办理商业银行个人住房贷款，在符合住房公积金个人住房贷款条件情况下，可申请转为住房公积金个人住房贷款。